インターネットはウイルス感染の一般的な手段ですが、フロッピーディスクもいまだに重要なウイルス感染経路の一つです。 使用したフロッピーディスクすべてをアンチウイルスでスキャンすることに加え、ブートウイルスの感染を避けるもうひとつの方法は、コンピュータを終了するとき、あるいは再起動するときにフロッピーディスクドライブからフロッピーディスクを取り出すことです。 ディスクを取り出し忘れたときのために、感染フロッピーディスクをチェックできるアンチウイルスプログラムをもつことは非常に有効です。